249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2819 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  100 
 
 
312 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  76.28 
 
 
312 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  75.73 
 
 
312 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  74.76 
 
 
312 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  69.58 
 
 
312 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  64.52 
 
 
312 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  65.3 
 
 
317 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  63.87 
 
 
312 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  63.78 
 
 
312 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  63.58 
 
 
315 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1292  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  63.87 
 
 
312 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  60.7 
 
 
313 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  58.58 
 
 
327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  57.93 
 
 
312 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0180  chlorophyll synthesis pathway, bchC  59.55 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  55.97 
 
 
318 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  55.97 
 
 
318 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  55.97 
 
 
318 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  37.11 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.92 
 
 
328 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  30.37 
 
 
334 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 
323 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.56 
 
 
321 aa  132  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.69 
 
 
325 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  29.23 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.1 
 
 
334 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.16 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.47 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.78 
 
 
340 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.78 
 
 
340 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  27.47 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.47 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.47 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  27.47 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.47 
 
 
340 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.16 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  29.09 
 
 
329 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.54 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.2 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  26.33 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0178  alcohol dehydrogenase  26.47 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1421  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.75 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  21.63 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  24.22 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.4 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4706  alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.74 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.73 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.32 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  24.37 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  26.93 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  23.26 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  26.05 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.5 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.45 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  25.4 
 
 
339 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  22.26 
 
 
356 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  25.72 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  28.18 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.14 
 
 
349 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  25.64 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.17 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.02 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.77 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3230  alcohol dehydrogenase  26.72 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  24.84 
 
 
336 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.89 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  22.6 
 
 
337 aa  59.3  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0154  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.13 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00186872  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  25.89 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.08 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.32 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.68 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20290  xylitol dehydrogeanse  27.38 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92253  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  26.04 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.88 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0262  alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.81 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  21.99 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  26.2 
 
 
350 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1608  putative Zn-dependent dehydrogenase  25.37 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.587808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11924  dehydrogenase  29.46 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3239  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.94 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  22.33 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.93 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  23.64 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3497  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.93 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.157273  normal  0.487323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1841  alcohol dehydrogenase  30.16 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.29 
 
 
348 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  32.88 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.67 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  24.07 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>