More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3747 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
323 aa  642    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  87.93 
 
 
327 aa  562  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.08 
 
 
328 aa  318  9e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  39.06 
 
 
334 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.62 
 
 
325 aa  225  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.15 
 
 
321 aa  222  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.19 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  38.12 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  36.99 
 
 
334 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  35.62 
 
 
334 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  38.92 
 
 
312 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  39.2 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  37.34 
 
 
312 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  36.71 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  36.88 
 
 
315 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  36.36 
 
 
312 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  37.27 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  36.2 
 
 
312 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  36.2 
 
 
312 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  36.34 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  33.75 
 
 
312 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  34.98 
 
 
312 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1292  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  35.56 
 
 
312 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  36.68 
 
 
312 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  33.02 
 
 
318 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  33.02 
 
 
318 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  31.4 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  27.41 
 
 
318 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0180  chlorophyll synthesis pathway, bchC  32.72 
 
 
325 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  28.44 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.99 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.41 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.27 
 
 
319 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  26.02 
 
 
318 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.71 
 
 
320 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  28.01 
 
 
329 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  26.81 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.51 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  26.8 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.51 
 
 
340 aa  89  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.51 
 
 
340 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.22 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.22 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  26.22 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.22 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.94 
 
 
340 aa  86.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.78 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.07 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.18 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.96 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1540  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.931266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  24.92 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.6 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.66 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  23.2 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  27.27 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  26.48 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.41 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.49 
 
 
357 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  23.26 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1860  alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.710452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.06 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1736  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.39 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  24.15 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  23.15 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.36 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  27.36 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.41 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.43 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.79 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  23.53 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.4 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0265  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.74 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.901967  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5645  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.419975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  26.5 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.24 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.24 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3514  alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  23.03 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  28.21 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3769  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.67 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.49 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.21 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.73 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.5 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  28.16 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  25.83 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  27.21 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0669  alcohol dehydrogenase  26.3 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.704397  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.09 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  21.67 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  25.59 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>