More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1181 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
319 aa  654    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.87 
 
 
318 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.41 
 
 
318 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  64.47 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.47 
 
 
320 aa  431  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  62.89 
 
 
318 aa  431  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  58.28 
 
 
318 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.98 
 
 
328 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 
327 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  26.54 
 
 
323 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.58 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  23.87 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  22.96 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  23.21 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  22.96 
 
 
334 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  21.45 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  21.45 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.81 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.49 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  22.44 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.81 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  21.26 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  21.18 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  21.47 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  21.79 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  25.42 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.49 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.71 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  21.97 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.28 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.81 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.79 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.95 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.19 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1292  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  21.71 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  22.87 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  24.45 
 
 
343 aa  62.4  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  22.9 
 
 
350 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  25.36 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  22.53 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  25.65 
 
 
342 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.03 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.51 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.42 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  24.52 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  27.15 
 
 
213 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.61 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.46 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
345 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.21 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  20.81 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.94 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.13 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  22.7 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.43 
 
 
357 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.13 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.28 
 
 
329 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.48 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  22.9 
 
 
327 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.74 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.22 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00294504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.38 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  24.92 
 
 
349 aa  56.2  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  23.65 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  21.68 
 
 
317 aa  55.8  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.65 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  22.68 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  23.31 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  22.31 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.82 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6366  alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  21.27 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.89 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.65 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  25.59 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.05 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.47 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.03 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  22.65 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  27.03 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  27.03 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4384  alcohol dehydrogenase  27 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  22.65 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.65 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.47 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  22.77 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  27.31 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  22.77 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  22.77 
 
 
347 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  22.77 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.31 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>