More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6366 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6366  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
207 aa  407  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0463  alcohol dehydrogenase  89.37 
 
 
315 aa  363  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3236  alcohol dehydrogenase  63.9 
 
 
311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  52.91 
 
 
312 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4738  alcohol dehydrogenase  55.34 
 
 
311 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0586  alcohol dehydrogenase  54.63 
 
 
312 aa  187  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  33.49 
 
 
351 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  33.18 
 
 
344 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
355 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  31.66 
 
 
347 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.78 
 
 
349 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  32.21 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2512  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.881464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.04 
 
 
368 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1727  zinc-binding dehydrogenase  30.8 
 
 
352 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  29.67 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.67 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  29.67 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.02 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  29.67 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  29.67 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.33 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.67 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0570  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.27 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.63 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.63 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.47 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.32 
 
 
357 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.66 
 
 
346 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  28.16 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1565  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.81 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.965017  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  32.03 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  27.56 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
348 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4673  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.54 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 
336 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.29 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  31.77 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  26.48 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  27.8 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  31.28 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.6 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  26.14 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.54 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.81 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.6 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  27.98 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  30.81 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1718  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0709  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2432  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1160  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.77 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0753  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1234  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.24 
 
 
344 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1010  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.06 
 
 
340 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0739  zinc-containing alcohol dehydrogenase; sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  29.06 
 
 
340 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.725171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.43 
 
 
340 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.92 
 
 
340 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.92 
 
 
340 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.45 
 
 
341 aa  72  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
340 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  27.1 
 
 
344 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  28.23 
 
 
343 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  27.75 
 
 
343 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  27.75 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.43 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.43 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06010  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.31 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  30.43 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.43 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  27.75 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2673  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.02 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  27.75 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3661  alcohol dehydrogenase  28.22 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1928  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2536  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.563542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  23.18 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>