More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3287 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  66.47 
 
 
343 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.47 
 
 
343 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  66.47 
 
 
343 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  66.47 
 
 
343 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  66.47 
 
 
343 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  65.01 
 
 
343 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  70.21 
 
 
343 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  65.01 
 
 
343 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  64.72 
 
 
343 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  64.72 
 
 
343 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  64.72 
 
 
343 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  48.27 
 
 
347 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  48.26 
 
 
350 aa  346  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.57 
 
 
343 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.68 
 
 
352 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.14 
 
 
356 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
352 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  43.68 
 
 
352 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.4 
 
 
343 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.12 
 
 
347 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
345 aa  269  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  43.64 
 
 
347 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  44.3 
 
 
343 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  40.99 
 
 
343 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  40.41 
 
 
345 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  43.99 
 
 
344 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  41.16 
 
 
347 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.72 
 
 
344 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  45.57 
 
 
342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.29 
 
 
344 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.78 
 
 
345 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.72 
 
 
348 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.82 
 
 
345 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.52 
 
 
343 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
347 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 
358 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.35 
 
 
349 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
349 aa  219  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
345 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.78 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.69 
 
 
342 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.61 
 
 
345 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  37.85 
 
 
355 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.01 
 
 
356 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.35 
 
 
349 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  32.02 
 
 
342 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.53 
 
 
368 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  33.11 
 
 
341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.44 
 
 
341 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.51 
 
 
340 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 
341 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  35.18 
 
 
359 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.49 
 
 
352 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.11 
 
 
345 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.75 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  30.56 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.23 
 
 
359 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.44 
 
 
352 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.08 
 
 
336 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.05 
 
 
346 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.68 
 
 
347 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.46 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  31.16 
 
 
379 aa  153  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.65 
 
 
351 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.82 
 
 
344 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.38 
 
 
344 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  30.56 
 
 
373 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  32.55 
 
 
583 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  28.8 
 
 
375 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  33.87 
 
 
352 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
344 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
352 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  28.21 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  27.59 
 
 
339 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.46 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  27.46 
 
 
339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  27.46 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  28.94 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  31.4 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  27.46 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  26.88 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.8 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  26.3 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
348 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2923  L-threonine 3-dehydrogenase  31.64 
 
 
349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  29.51 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  28.82 
 
 
416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  27.14 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  28.21 
 
 
342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.27 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  26.96 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.51 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.51 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>