More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3236 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3236  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 311 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0463  alcohol dehydrogenase  60.51 
 
 		 315 aa  349  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  56.91 
 
 		 312 aa  338  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4738  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0586  alcohol dehydrogenase  56.27 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6366  alcohol dehydrogenase  63.9 
 
 		 207 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.88 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.09 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3317  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.09 
 
 		 338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  hitchhiker  0.0000240679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.42 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.07 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  33.77 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5642  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.25 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2739  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.5 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.112956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.72 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6367  alcohol dehydrogenase  57.73 
 
 		 98 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.29 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4898  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.9 
 
 		 340 aa  108  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  30.64 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.29 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  28.4 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4903  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0102074  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3697  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587402 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04235  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.57 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.767219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3639  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.23 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.23 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.774265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4590  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.57 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00423136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 342 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.92 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.54 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  27.02 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.93 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  30.77 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.83 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5871  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.24 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.32 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  29.75 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  27.71 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.41 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0065  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.69 
 
 		 340 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.62 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  28.66 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.51 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.99 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0797  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.89 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121673  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.66 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.94 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  26.52 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5213  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.59 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000291101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 		 345 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.52 
 
 		 352 aa  99.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0059  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1489  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.31 
 
 		 373 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.434256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.31 
 
 		 342 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  24.85 
 
 		 347 aa  99  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  24.85 
 
 		 347 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.98 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.85 
 
 		 347 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  24.85 
 
 		 347 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  25.37 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 		 335 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0464  alcohol dehydrogenase  29.43 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00255381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.55 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  24.85 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3054  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.09 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.680504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  24.85 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0619  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.23 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1260  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.1 
 
 		 339 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.785941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  29.88 
 
 		 344 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0992  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.17 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.08 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 		 347 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 		 352 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0770  alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00613196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  24.26 
 
 		 347 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.8 
 
 		 345 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  30.8 
 
 		 345 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 		 351 aa  95.5  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1409  alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.08 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>