More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4748 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  99.42 
 
 
343 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  99.13 
 
 
343 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  99.42 
 
 
343 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  716    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  99.42 
 
 
343 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  83.38 
 
 
343 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  83.38 
 
 
343 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  83.09 
 
 
343 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  83.38 
 
 
343 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  83.09 
 
 
343 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  66.47 
 
 
344 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  69.03 
 
 
343 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  46.8 
 
 
350 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  46.51 
 
 
347 aa  341  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  46.84 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.52 
 
 
343 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42 
 
 
356 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.67 
 
 
352 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.35 
 
 
347 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  42.37 
 
 
345 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.94 
 
 
343 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  44.94 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  43.85 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  46.98 
 
 
342 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  43.35 
 
 
347 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.44 
 
 
348 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.72 
 
 
345 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.62 
 
 
343 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  42.06 
 
 
347 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.16 
 
 
345 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  39.56 
 
 
358 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 
345 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.82 
 
 
344 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.14 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
347 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.2 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  40.19 
 
 
349 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
345 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.69 
 
 
342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.6 
 
 
345 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  38.56 
 
 
345 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.98 
 
 
342 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.38 
 
 
368 aa  185  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  31.38 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
355 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.26 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.05 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.49 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  34.74 
 
 
359 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.62 
 
 
352 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.92 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
341 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.37 
 
 
333 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  29.23 
 
 
341 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  30.38 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.06 
 
 
359 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.09 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.22 
 
 
349 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.41 
 
 
345 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 
583 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  29.51 
 
 
379 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.92 
 
 
336 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.78 
 
 
344 aa  153  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
351 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.77 
 
 
347 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.18 
 
 
360 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  30.72 
 
 
373 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.48 
 
 
347 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.94 
 
 
344 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40172  Sorbitol dehydrogenase (L-iditol 2-dehydrogenase)  29.68 
 
 
381 aa  143  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.859827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  31.6 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.28 
 
 
343 aa  139  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
347 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  30.9 
 
 
352 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  28.65 
 
 
416 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.06 
 
 
347 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  29.55 
 
 
347 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  29.55 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  29.55 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.55 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00942  hypothetical protein similar to L-arabitol dehydrogenase (Eurofung)  28.65 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  29.55 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  29.22 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
347 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  26.8 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  27.3 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  28.48 
 
 
347 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  26.95 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  26.74 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.74 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  26.74 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  30.35 
 
 
363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.74 
 
 
339 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  26.74 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>