More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0221 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  712    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  70.5 
 
 
343 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  70.21 
 
 
343 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  70.8 
 
 
343 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  70.5 
 
 
343 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  70.21 
 
 
343 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  69.03 
 
 
343 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.03 
 
 
343 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  69.03 
 
 
343 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  69.03 
 
 
343 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  70.21 
 
 
344 aa  501  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  69.03 
 
 
343 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  48.67 
 
 
350 aa  342  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  47.66 
 
 
347 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.15 
 
 
343 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.57 
 
 
343 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.41 
 
 
356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.82 
 
 
352 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 
352 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 
352 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.82 
 
 
347 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  43.53 
 
 
347 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  42.57 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  43.85 
 
 
343 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
347 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  43.99 
 
 
344 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.04 
 
 
345 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.77 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.67 
 
 
343 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 
342 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  40.12 
 
 
347 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.62 
 
 
348 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.51 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  39.23 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.19 
 
 
345 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  40.5 
 
 
358 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.41 
 
 
349 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.58 
 
 
349 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.69 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.38 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  37.61 
 
 
345 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.24 
 
 
345 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.5 
 
 
340 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  32.33 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.77 
 
 
356 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
342 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.11 
 
 
352 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.02 
 
 
368 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
355 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  31.72 
 
 
341 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  32.22 
 
 
345 aa  160  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.81 
 
 
347 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.07 
 
 
341 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 
341 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.56 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.91 
 
 
346 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.29 
 
 
349 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  32.57 
 
 
359 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.29 
 
 
333 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  32.61 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  29.53 
 
 
348 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  31.8 
 
 
379 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.22 
 
 
347 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.13 
 
 
344 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  33.77 
 
 
336 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.56 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.98 
 
 
352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  28.24 
 
 
416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.59 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.11 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1455  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.85 
 
 
351 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.124496 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08109  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
583 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.401765  normal  0.665757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.4 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4353  alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  26.15 
 
 
339 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  25.58 
 
 
339 aa  126  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
352 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  27.65 
 
 
346 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  28.81 
 
 
375 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
340 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  25.29 
 
 
339 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.29 
 
 
339 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
340 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  25.29 
 
 
339 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  27.13 
 
 
339 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
346 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  25.29 
 
 
339 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.03 
 
 
339 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  27.46 
 
 
339 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
344 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  27.46 
 
 
339 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3219  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.85 
 
 
347 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.12 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
348 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  27.12 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  27.12 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>