More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2131 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2131  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
349 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1003  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.1 
 
 
342 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.124693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  72.94 
 
 
345 aa  461  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3277  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  70.93 
 
 
345 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5057  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.54 
 
 
340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  55.13 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.22 
 
 
349 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.48 
 
 
368 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  46.96 
 
 
355 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  39.6 
 
 
350 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.31 
 
 
348 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
345 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0836  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.11 
 
 
347 aa  226  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5333  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.4 
 
 
345 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0397204  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4094  alcohol dehydrogenase  39.59 
 
 
358 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.958788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  36.72 
 
 
347 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.83 
 
 
343 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  44.06 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  41.33 
 
 
343 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.53 
 
 
343 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
352 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.96 
 
 
347 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.26 
 
 
352 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  41.96 
 
 
352 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3287  L-idonate 5-dehydrogenase  38.35 
 
 
344 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  39.31 
 
 
344 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  37.76 
 
 
343 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3565  alcohol dehydrogenase  38.55 
 
 
345 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.9 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3685  alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
347 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.112233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2879  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.09 
 
 
345 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4748  L-idonate 5-dehydrogenase  34.69 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4523  L-idonate 5-dehydrogenase  34.69 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0181227  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.6 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.477759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04133  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  34.69 
 
 
343 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3730  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.69 
 
 
343 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04097  hypothetical protein  34.69 
 
 
343 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5671  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.18 
 
 
343 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  37.21 
 
 
342 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.92 
 
 
342 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.52 
 
 
356 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4771  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 
344 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107599 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4739  L-idonate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 
343 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3523  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  38.28 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.538037  normal  0.114116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4832  L-idonate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4869  L-idonate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 
343 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0951463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4769  L-idonate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 
343 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0966138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4888  L-idonate 5-dehydrogenase  34.71 
 
 
343 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138899  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0221  L-idonate 5-dehydrogenase  35.29 
 
 
343 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
347 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
341 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  34.87 
 
 
341 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
341 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.94 
 
 
346 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.46 
 
 
352 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1714  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.64 
 
 
352 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2013  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.91 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.238084  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  31.99 
 
 
379 aa  153  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.87 
 
 
333 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  28.94 
 
 
348 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  35.73 
 
 
352 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.09 
 
 
347 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  34.76 
 
 
345 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6662  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.838814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.94 
 
 
360 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  33.69 
 
 
373 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1899  L-threonine 3-dehydrogenase  35.03 
 
 
341 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198837  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01090  xylitol dehydrogenase, putative  32.56 
 
 
375 aa  142  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.42 
 
 
373 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
373 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  33.52 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00774  zinc-dependent alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14390)  30.69 
 
 
400 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2341  alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 
348 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
362 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  33.06 
 
 
354 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.69 
 
 
347 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2377  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1037  L-threonine 3-dehydrogenase  34.46 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.210217  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3271  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.39 
 
 
336 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0405628 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  30.36 
 
 
359 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  33.52 
 
 
362 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.96 
 
 
367 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  33.24 
 
 
363 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00100  L-arabinitol 4-dehydrogenase, putative  29.63 
 
 
392 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.603371  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
354 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  32.96 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.14 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.39 
 
 
359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.5 
 
 
354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
365 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
373 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
354 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1742  D-xylulose reductase  32.19 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.247806  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02580  sorbitol dehydrogenase, putative  30.61 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4389  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.07 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.189858  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  30.73 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>