201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1528 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
320 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  72.96 
 
 
318 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  69.5 
 
 
318 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.81 
 
 
318 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  66.13 
 
 
318 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.47 
 
 
319 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.52 
 
 
318 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.7 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  27.19 
 
 
334 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.15 
 
 
321 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  26.85 
 
 
332 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  25.47 
 
 
327 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.01 
 
 
334 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  25.16 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  24.16 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25.08 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  24.07 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.25 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.72 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  23.81 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.49 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  24.38 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  25 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  24.2 
 
 
327 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25.32 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  23.17 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25.63 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  22.87 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1292  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  23.57 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  23.15 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  25.52 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  23.96 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  25.69 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.67 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  21.88 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.57 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.57 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.91 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.09 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  20.39 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  27.85 
 
 
213 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  20.39 
 
 
352 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  20.39 
 
 
352 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.49 
 
 
335 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.46 
 
 
308 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  21.54 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1347  alcohol dehydrogenase  22.89 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.71457  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  20.45 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  23.58 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.27 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  20.3 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.56 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.46 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.2 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  21.6 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  20.96 
 
 
375 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  23.94 
 
 
336 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.06 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.82 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  23.94 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  26.1 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.08 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.7 
 
 
345 aa  53.5  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  20.88 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  20.71 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  24.64 
 
 
322 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  22.98 
 
 
337 aa  52.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  19.93 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  19.93 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  23.46 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.22 
 
 
341 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.4 
 
 
312 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  22.58 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1696  threonine dehydrogenase  23.89 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000265476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  21.51 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.08 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1581  alcohol dehydrogenase  25.09 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.53 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  22.09 
 
 
345 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3988  alcohol dehydrogenase  24.9 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.856682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  20.75 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  22.16 
 
 
339 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.31 
 
 
332 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  23.12 
 
 
351 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  22.55 
 
 
358 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  22.22 
 
 
357 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1700  threonine dehydrogenase  21.75 
 
 
346 aa  49.3  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.333284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  21.09 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.09 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  22.3 
 
 
358 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.23 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.75 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.44 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  22.22 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2565  L-threonine 3-dehydrogenase  21.82 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  21.09 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  23.85 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>