89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1078 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  36.58 
 
 
342 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  34.63 
 
 
340 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  36.11 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.59 
 
 
328 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
334 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  38.85 
 
 
346 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  35.87 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  35.8 
 
 
337 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  37.73 
 
 
337 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  37.89 
 
 
329 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  37.76 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.74 
 
 
307 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.54 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  34.85 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.81 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.05 
 
 
343 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.28 
 
 
345 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.5 
 
 
338 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  41.03 
 
 
289 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  34.85 
 
 
326 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  30.1 
 
 
1005 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.92 
 
 
356 aa  59.3  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  26.34 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.55 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89701  polyol dehydrogenase  29.26 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  25.82 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.91 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.15 
 
 
350 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  32.61 
 
 
344 aa  52.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  23.38 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  26.16 
 
 
325 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.69 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.1 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.89 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02158  alcohol dehydrogenase, zinc-containing (AFU_orthologue; AFUA_2G15930)  26.67 
 
 
353 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.953823  normal  0.515496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  26.45 
 
 
699 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.66 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4509  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.28 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2272  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  21.85 
 
 
1079 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.32 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  24.89 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.39 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  23.46 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0656  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.71 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  24.03 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3324  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.66 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.04 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.1 
 
 
308 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1537  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.98 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.46 
 
 
373 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  25.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.73 
 
 
350 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.31 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1144  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.81 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.129111 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.16 
 
 
327 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  21.65 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.47 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.98 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  23.98 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.59 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00599  conserved hypothetical protein  21.05 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.932146  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.62 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  23.59 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  22.84 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3903  alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  27.1 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3303  zinc-binding dehydrogenase family protein  22.97 
 
 
338 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0731443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  25.97 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.42 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3875  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.9 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.177678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
724 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.4 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  22.05 
 
 
337 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.59 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2277  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.14 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  hitchhiker  0.000159352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>