97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1178 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  100 
 
 
325 aa  651    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  58.57 
 
 
332 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  57.1 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  58.68 
 
 
329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  50.31 
 
 
340 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  54.1 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  57.81 
 
 
337 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  49.69 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.35 
 
 
328 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  58.75 
 
 
326 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  58.75 
 
 
326 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  55.9 
 
 
360 aa  285  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
334 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.98 
 
 
307 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  53.47 
 
 
289 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  36.11 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.1 
 
 
336 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.53 
 
 
343 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.54 
 
 
338 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.67 
 
 
342 aa  139  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.87 
 
 
345 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  28.52 
 
 
1005 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.85 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
327 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 
1080 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.05 
 
 
367 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.74 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
724 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 
734 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  23.32 
 
 
722 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
699 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.77 
 
 
369 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.52 
 
 
341 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.52 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  29.03 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.52 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  27.78 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.17 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.66 
 
 
348 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  24.25 
 
 
713 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 
715 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  23.83 
 
 
712 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.48 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
721 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
715 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0087  alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
1079 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1527  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.64 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
327 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.95 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1805  alcohol dehydrogenase  25.75 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.657982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  28.57 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.68 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  34.87 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0075  sorbitol dehydrogenase, putative  23.3 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 
323 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  22.4 
 
 
318 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.1 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.7 
 
 
367 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  22.73 
 
 
308 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  22.73 
 
 
308 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 
337 aa  45.8  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  22.4 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.32 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.07 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.53 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  26.87 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21210  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  36.44 
 
 
336 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0944  L-idonate 5-dehydrogenase  26.39 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.272351  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1538  L-idonate 5-dehydrogenase  27.7 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  24.21 
 
 
213 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.57 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  30.91 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4289  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.26 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3616  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  25.17 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.78 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  21.54 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  26.9 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2124  L-idonate 5-dehydrogenase, NAD-binding  25.37 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  26.41 
 
 
719 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.58 
 
 
746 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.88 
 
 
351 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  25 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.46 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3519  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  25.36 
 
 
347 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02880  L-iditol 2-dehydrogenase, putative  30 
 
 
400 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  24.6 
 
 
347 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.02 
 
 
366 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.56 
 
 
344 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000105685  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0513  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.92 
 
 
360 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  25 
 
 
375 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>