130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0642 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0642  dehydrogenase  100 
 
 
342 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0795  dehydrogenase  76.6 
 
 
340 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2745  putative dehydrogenase  58.68 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000542225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1178  putative dehydrogenase  49.69 
 
 
325 aa  332  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0315  putative dehydrogenase  54.89 
 
 
329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1679  dehydrogenase  58.44 
 
 
360 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2751  hypothetical protein  61.8 
 
 
326 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.794948  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2564  hypothetical protein  60.25 
 
 
326 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.172199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3598  putative dehydrogenase  52.19 
 
 
337 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927271  hitchhiker  0.00450633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2453  putative dehydrogenase  47.06 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0767  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.62 
 
 
328 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1678  putative dehydrogenase  45.94 
 
 
346 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2316  alcohol dehydrogenase  48.66 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4664  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.05 
 
 
307 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1078  putative dehydrogenase  36.58 
 
 
343 aa  209  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4783  alcohol dehydrogenase  45.27 
 
 
289 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1999  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.36 
 
 
336 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.131571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0522  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0876145  normal  0.61344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2577  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.23 
 
 
342 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.1 
 
 
345 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1232  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.93 
 
 
343 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38005  predicted protein  27.86 
 
 
1005 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2207  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.01 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  25.3 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  37.6 
 
 
699 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.11 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0934  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.69 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
1079 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
719 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  33.33 
 
 
312 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3336  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.56 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  28.98 
 
 
713 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 
721 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2683  alcohol dehydrogenase  25.18 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.01 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
712 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1296  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.07 
 
 
369 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4595  hypothetical protein  25 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  27.01 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 
734 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  27.97 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.71 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 
715 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  23.81 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
329 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  29.1 
 
 
722 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.42 
 
 
371 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.42 
 
 
371 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  26.42 
 
 
371 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1529  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.06 
 
 
369 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.237052  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.05 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2451  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0598  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.6 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122264  normal  0.243738 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  22.84 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
724 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  23.02 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.29 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.96 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3364  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.16 
 
 
367 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0600954 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.15 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1794  alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0373035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0607  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  23.25 
 
 
324 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420026  normal  0.0271059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1646  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.26 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3903  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
719 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3943  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.1 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0142481  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3977  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  24.08 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3921  alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1654  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  26.09 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1794  zinc-type alcohol dehydrogenase  25.2 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.12 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0049  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.31 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.92 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3918  alcohol dehydrogenase  30.46 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0508514  normal  0.13428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.34 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2374  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.16 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000195271  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0667  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.39 
 
 
357 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.559998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4348  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  46.25 
 
 
351 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.452573  normal  0.778555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1007  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
348 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.8 
 
 
336 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  25.31 
 
 
342 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.95 
 
 
316 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  24.43 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.87 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  21.07 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.35 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  25.42 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  30.85 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.57 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  21.94 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.22 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  25.93 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>