More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1431 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 400 aa  787    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4169  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.235444  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2111  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.55 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1999  alcohol dehydrogenase  40.44 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0396672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2206  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.75 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.4 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.164909  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0483  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  35.84 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.938147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1324  alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2251  alcohol dehydrogenase  36.97 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0697  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.13 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2277  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  hitchhiker  0.000159352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.77 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 		 327 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.37 
 
 		 323 aa  99.4  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.04 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.551512  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2828  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155527  normal  0.0877096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2811  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 		 347 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.35 
 
 		 336 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  27.68 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0343  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 		 312 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.76 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.26 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0973  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  29.39 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.465963 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0948  putative L-idonate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  27.83 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.57 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.87 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  30.26 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.2 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2227  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  29.05 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.47 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.03 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2286  alcohol dehydrogenase  25.61 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  31.02 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01983  hypothetical protein  28.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02017  galactitol-1-phosphate dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1567  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0173762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3070  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862081  hitchhiker  0.00000818535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2379  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.72 
 
 		 346 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.83 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1000  putative alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1147  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  28.72 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.6 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  25.87 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  28.66 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1079  alcohol dehydrogenase  23.8 
 
 		 342 aa  87  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.79 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  32.09 
 
 		 336 aa  87  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.75 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  27.07 
 
 		 365 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  26.26 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.25 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  24.6 
 
 		 343 aa  86.7  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0849  alcohol dehydrogenase  26.23 
 
 		 344 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0438742 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3545  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 		 345 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.715464  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09288  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  86.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.7 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  24.32 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2609  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.5 
 
 		 348 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  26.35 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  25 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  25 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4479  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.71 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.522798  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1589  alcohol dehydrogenase  28.27 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  23.51 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15800  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  28.34 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  26.55 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  26.26 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3810  alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0863215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.69 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  26.74 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  27.27 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  24.73 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  27.83 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.75 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.13 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  26.53 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  26.38 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  25.59 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>