More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2206 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2206  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
405 aa  831    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0697  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.46 
 
 
408 aa  422  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1324  alcohol dehydrogenase  39.59 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2251  alcohol dehydrogenase  38.31 
 
 
415 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2111  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 
403 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.27 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.8 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.164909  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4169  alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
420 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.235444  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1999  alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
395 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0396672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0483  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  32.13 
 
 
383 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.938147  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2277  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
382 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  hitchhiker  0.000159352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.54 
 
 
347 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.36 
 
 
341 aa  136  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  29.09 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
339 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
327 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  28.53 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  28.53 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  28.12 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.15 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  28.53 
 
 
339 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 
341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  25.97 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  29.23 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  27.69 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
350 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  27.5 
 
 
341 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
358 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  27.65 
 
 
343 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.01 
 
 
350 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.4 
 
 
343 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5030  zinc-binding dehydrogenase  27.57 
 
 
343 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.959168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  28.8 
 
 
341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  28.8 
 
 
341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  28.8 
 
 
341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  28.8 
 
 
341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  28.8 
 
 
341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  27.88 
 
 
341 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  27.37 
 
 
343 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.49 
 
 
344 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.85 
 
 
343 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  28.34 
 
 
341 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  28.34 
 
 
341 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.36 
 
 
340 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  28.34 
 
 
341 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  27.88 
 
 
341 aa  122  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  26.61 
 
 
340 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  28.42 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  27.42 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  26.61 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.45 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  28.07 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  29.08 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  27.69 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  26.59 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  27.42 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  28.42 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.45 
 
 
347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  28.71 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  28.8 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  27.42 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  28.07 
 
 
341 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.49 
 
 
356 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.95 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  27.91 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.56 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  27.64 
 
 
345 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  28.26 
 
 
341 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0038  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
340 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.32 
 
 
356 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
344 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  27.81 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  28.34 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1141  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  27.96 
 
 
347 aa  119  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.261059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  27.81 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  28.26 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.52 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  27.81 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.06 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  26.36 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  27.54 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  27.01 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  26.58 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  27.61 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  26.58 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  27.99 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  27.49 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>