More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1908 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  822    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  58.51 
 
 		 391 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  62.66 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  59.27 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  57.22 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  57.22 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  35.45 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  36.19 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.17 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  26.87 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.57 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.04 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.74 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.04 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  28.74 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.18 
 
 		 320 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 458 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.95 
 
 		 338 aa  90.5  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  29.37 
 
 		 353 aa  90.5  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  28.98 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  28.98 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  31.22 
 
 		 352 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 468 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  28.98 
 
 		 367 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 333 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.49 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.57 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  36.08 
 
 		 340 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  28.57 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  26.44 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.4 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 392 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 699 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.66 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 		 667 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  29.85 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.9 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.94 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  29.53 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  26.92 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.73 
 
 		 667 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.46 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  32.66 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 667 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  34.67 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  29.23 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.66 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.13 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.71 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  30.05 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>