More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2924 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2924  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
404 aa  809    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  65.58 
 
 
400 aa  530  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4806  oxidoreductase domain-containing protein  63.87 
 
 
391 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4959  oxidoreductase domain protein  62.09 
 
 
395 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.114649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2780  oxidoreductase domain protein  62.09 
 
 
395 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779998  normal  0.106115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1908  4,5-dihydroxyphthalate dehydrogenase  62.66 
 
 
399 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
409 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
409 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  38.52 
 
 
409 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  38.52 
 
 
409 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  37.28 
 
 
409 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  37.28 
 
 
409 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.09 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.09 
 
 
329 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 
365 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
331 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 
344 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.2 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 
329 aa  99  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.68 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
372 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 
342 aa  96.3  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  33.71 
 
 
332 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 
349 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  29.8 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 
347 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  34.62 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.48 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 
667 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 
433 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  40 
 
 
336 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
331 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  34.13 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  34.13 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  34.13 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  34.13 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  34.13 
 
 
345 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
468 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  28.35 
 
 
342 aa  89.4  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.92 
 
 
353 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.73 
 
 
313 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  36.77 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
334 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1209  putative oxidoreductase YjhC  27.43 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.016444  normal  0.354705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  37.5 
 
 
338 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
667 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  32.46 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1228  putative oxidoreductase YjhC  27.43 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1243  putative oxidoreductase YjhC  27.43 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.281927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
343 aa  87  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  29.96 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
329 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.49 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  32.29 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
358 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1198  putative oxidoreductase YjhC  27 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.84 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  31.03 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  31.43 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  33.01 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 
667 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 
349 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.33 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.45 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  30.43 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.62 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  29 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  32.39 
 
 
328 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.39 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.76 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>