More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02580 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  100 
 
 		 384 aa  773    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  78.91 
 
 		 384 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  78.91 
 
 		 384 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  52.14 
 
 		 385 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  43.31 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  47.62 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  47.34 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  36.7 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  32.58 
 
 		 438 aa  179  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 468 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 458 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 		 435 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  35.03 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  29.61 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 433 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  32.46 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  31.5 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 347 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.89 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.88 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.27 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  28.86 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.99 
 
 		 343 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  29.08 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  26.88 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 324 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  31.03 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.33 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.84 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.33 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 340 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  29.88 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 667 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  30.47 
 
 		 328 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  27.95 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 667 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  22.53 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  28.26 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 667 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  27.63 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 667 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.68 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  22.8 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.49 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  25.38 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 341 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  27.11 
 
 		 335 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.67 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  28.38 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 665 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.87 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  32.81 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  28.94 
 
 		 360 aa  90.1  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.12 
 
 		 337 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 		 325 aa  89.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  33.17 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  32.68 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  28.45 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.54 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  26.42 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>