More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4698 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
331 aa  650    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  51.08 
 
 
337 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  45.37 
 
 
336 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  47.35 
 
 
337 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  36.86 
 
 
325 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  40.68 
 
 
330 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  36.14 
 
 
324 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
337 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.06 
 
 
332 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  33.45 
 
 
328 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2126  putative NDP-hexose-3-ketoreductase  30.21 
 
 
323 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.298904  normal  0.723629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
342 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
328 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.62 
 
 
328 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.62 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.1 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  31.09 
 
 
330 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.14 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 
328 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
325 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.83 
 
 
388 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  33.66 
 
 
328 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  33.11 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  29.63 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  34.81 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  32.09 
 
 
327 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 
338 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 
667 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.13 
 
 
338 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
468 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  32.27 
 
 
326 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 
667 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.62 
 
 
667 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.6 
 
 
332 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.41 
 
 
342 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 
329 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  36.19 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  35.02 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  44.02 
 
 
345 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  34.69 
 
 
327 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
458 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  34.47 
 
 
336 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
373 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  33.16 
 
 
408 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.46 
 
 
320 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 
433 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  29.9 
 
 
370 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
385 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 
384 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 
384 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 
323 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
321 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  34.56 
 
 
327 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  38.21 
 
 
335 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  24.16 
 
 
342 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
321 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
334 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
332 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  28.46 
 
 
328 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  33.09 
 
 
376 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  37.66 
 
 
379 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.95 
 
 
665 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
667 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  30.47 
 
 
432 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  34.7 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  38.12 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
435 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
435 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  35.44 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.41 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  25.4 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
435 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  32.03 
 
 
351 aa  96.3  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
354 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
356 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  38.19 
 
 
352 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  36.81 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.89 
 
 
670 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  26.34 
 
 
438 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
365 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  26.9 
 
 
343 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.1 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  32.28 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.41 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
370 aa  91.3  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>