More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4116 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 373 aa  780    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  46.98 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2895  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.75 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.61 
 
 		 667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  33.07 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  29.18 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.43 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 332 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.8 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  27.79 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.06 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 331 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.32 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 667 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  39.02 
 
 		 667 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  28.15 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.75 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  30.95 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  27.2 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.77 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  27.78 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.74 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 667 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 329 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.35 
 
 		 328 aa  99.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 336 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.03 
 
 		 338 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.06 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 		 325 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  31.72 
 
 		 328 aa  96.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  30.6 
 
 		 336 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 330 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 		 343 aa  93.2  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  32.31 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  23.33 
 
 		 342 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 338 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  31.98 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  31.38 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  29.06 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  29.12 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  27.68 
 
 		 388 aa  86.7  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  27.95 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.09 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.76 
 
 		 670 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  28.2 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  28.29 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.25 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  38.76 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.25 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  32.78 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 366 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 665 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.52 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  27.66 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  32.58 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  24.91 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  30.41 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.77 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.99 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>