More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3596 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 332 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  56.35 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  58.82 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  52.91 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  46.77 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.71 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  33.44 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.95 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.47 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  30.65 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  33.93 
 
 		 343 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  28.65 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.65 
 
 		 667 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 667 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 		 667 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  32.29 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.75 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 		 667 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.05 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  31.82 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  31.29 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.54 
 
 		 328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.5 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  30.98 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  26.18 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  27.61 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  37.81 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  36.7 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  33.46 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 349 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.06 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.76 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 665 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.3 
 
 		 670 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  35.78 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  30.13 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.33 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  25.84 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  32.62 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  26.35 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  26.43 
 
 		 342 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  26.45 
 
 		 359 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  34.92 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  26.95 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  41.21 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  28.75 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.8 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 399 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.86 
 
 		 322 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  37.33 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 354 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.86 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  24.92 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.65 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  26.2 
 
 		 324 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  29.65 
 
 		 347 aa  93.2  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 336 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.17 
 
 		 396 aa  92.4  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.36 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  26.2 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.97 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.97 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.12 
 
 		 376 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  38.89 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  32.52 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>