More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2218 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  51.08 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  54.84 
 
 		 337 aa  281  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  45.91 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  34.89 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  41.18 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  36.53 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.69 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  33.56 
 
 		 388 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  30.2 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  33.33 
 
 		 328 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  33.23 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  32.21 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.24 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 		 468 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  37.32 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  29.57 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.52 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2126  putative NDP-hexose-3-ketoreductase  28.16 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.298904  normal  0.723629 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.52 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  33.09 
 
 		 667 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 667 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  34.53 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  31.63 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.67 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  34.62 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.8 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 		 667 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  34.72 
 
 		 665 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  31.56 
 
 		 432 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  32.11 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  29.67 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 667 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  32.31 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 385 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.88 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.12 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.77 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.57 
 
 		 438 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 435 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  29.44 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  31.75 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 435 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  41.45 
 
 		 665 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.41 
 
 		 670 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  31.5 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.74 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.63 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  36.87 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  36.67 
 
 		 356 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 321 aa  99.4  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  25.9 
 
 		 342 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  31.63 
 
 		 379 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 372 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 		 392 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  31.96 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  25.5 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  36.36 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.87 
 
 		 405 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  30.13 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>