More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0454 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 362 aa  728    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  72.3 
 
 		 352 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  79.46 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  45.71 
 
 		 329 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  45.14 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  47.25 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  41.14 
 
 		 331 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  39.66 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  39.71 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  39.26 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  42.74 
 
 		 338 aa  225  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  38.68 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  37.29 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  40.23 
 
 		 357 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  34.29 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  36.57 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  34.86 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  43.97 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  39.71 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  36.54 
 
 		 329 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  39.03 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  39.43 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  39.77 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  39.72 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  39.26 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  39.43 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  39.43 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  39.09 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  38 
 
 		 352 aa  189  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 		 321 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  37.22 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  35.2 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  36.72 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  37.71 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  38.11 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  37.54 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  31.43 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 667 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.73 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.73 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  31.06 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 326 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  31.81 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.88 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  32.14 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  30.64 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  30.6 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.97 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  37.98 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 667 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 667 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.56 
 
 		 670 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  30.73 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  28.12 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  32.77 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  31.21 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.57 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 667 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  37.65 
 
 		 665 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  32.76 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.08 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  33.62 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  31.43 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  41.36 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  25.19 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  36.33 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  32.28 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.39 
 
 		 332 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  39.3 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  32.31 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  34.1 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  29.79 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  31.92 
 
 		 328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  29.45 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.69 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  31.64 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  29.45 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  29.45 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  34.71 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  37.8 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.18 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>