More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01557 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  100 
 
 
362 aa  762    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  50.7 
 
 
369 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  44.24 
 
 
365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  44.76 
 
 
349 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  44 
 
 
392 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  42.09 
 
 
374 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  38.64 
 
 
398 aa  258  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  38.02 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  36.27 
 
 
372 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  38.61 
 
 
372 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  38.29 
 
 
375 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  39.01 
 
 
369 aa  238  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  34.2 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 
458 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 
365 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  33.24 
 
 
370 aa  205  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  33.33 
 
 
438 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
435 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 
435 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  34.51 
 
 
435 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
432 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
433 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.32 
 
 
405 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
405 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 
356 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
405 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.53 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
363 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
330 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
384 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
384 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
366 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.86 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  26.78 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
321 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 
343 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.48 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.76 
 
 
343 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.48 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.48 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.92 
 
 
343 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.92 
 
 
343 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.95 
 
 
362 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
331 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  23.49 
 
 
328 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  25.53 
 
 
330 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.92 
 
 
343 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  31.84 
 
 
328 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  32.35 
 
 
334 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  22.74 
 
 
324 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
329 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
336 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  25.92 
 
 
347 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  27.72 
 
 
326 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.57 
 
 
338 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.22 
 
 
343 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  23.21 
 
 
325 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.22 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
359 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 
359 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
347 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 
338 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  29.29 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.76 
 
 
355 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.04 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  27.64 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
364 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
342 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.61 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.35 
 
 
328 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.67 
 
 
323 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.77 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
667 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.5 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.35 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  27.81 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.46 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 
331 aa  89.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  27.98 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  23.69 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>