More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1334 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  100 
 
 		 327 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  55.52 
 
 		 322 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  49.52 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  49.69 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  48.91 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  45.94 
 
 		 327 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  48.9 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2234  oxidoreductase domain protein  46.44 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  29.24 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.67 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  25.68 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  29.18 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.77 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  29.44 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  32.22 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  31.82 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  25.44 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 667 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1023  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.972099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 		 376 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.11 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.15 
 
 		 438 aa  95.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  28.51 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 359 aa  94.4  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.32 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  25.72 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  27.03 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 393 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  25.97 
 
 		 365 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  30.74 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  33.78 
 
 		 334 aa  89.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 405 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30.26 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  30.6 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.76 
 
 		 359 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  30.27 
 
 		 350 aa  89  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.78 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  24.11 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  23.97 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.78 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  27.58 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 468 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  25.19 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.88 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 365 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  28.02 
 
 		 326 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.65 
 
 		 369 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  27.64 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.57 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5416  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 		 385 aa  85.9  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  31.67 
 
 		 342 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>