More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65576 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_65576  predicted protein  100 
 
 		 348 aa  704    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 		 325 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  32.08 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11260  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.305619  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07353  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16380)  28.4 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.550714 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04200  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  25.19 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05970  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 358 aa  86.7  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25.87 
 
 		 382 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.06 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.61 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  24.1 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48762  predicted protein  27.09 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  25.5 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  21.52 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0643  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  26.96 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2941  oxidoreductase domain-containing protein  25.1 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  27.76 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  24.47 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  23.45 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  25.08 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  25.99 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25.45 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  28.3 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.54 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  26.6 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  24.77 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  25.09 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1479  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.64 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  27.67 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.42 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  24.43 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  24.25 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  22.3 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  22.79 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  22.04 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  23.3 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  25.94 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  23.2 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  28.4 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  20.43 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  23.74 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  29.37 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>