More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0189 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  100 
 
 
366 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  99.18 
 
 
366 aa  748    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  58.89 
 
 
369 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  54.86 
 
 
355 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  54.1 
 
 
373 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  52.33 
 
 
365 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  52.05 
 
 
365 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  50.68 
 
 
365 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07991  putative oxidoreductase  50.69 
 
 
367 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.716989  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  52.15 
 
 
360 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  39.2 
 
 
370 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  39.2 
 
 
370 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  38.57 
 
 
371 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  38.83 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  38.89 
 
 
371 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  40.39 
 
 
374 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  37.71 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  37.6 
 
 
369 aa  236  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
346 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  29.09 
 
 
360 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
385 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
382 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.52 
 
 
377 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 
378 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 
396 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.3 
 
 
376 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.84 
 
 
377 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
364 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
366 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 
381 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  25.16 
 
 
393 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  25 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 
376 aa  96.3  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 
359 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  30.17 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.11 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  29.28 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  29.28 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
381 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 
373 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  23.16 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07261  hypothetical protein  28.52 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
374 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.78 
 
 
353 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  25.85 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.18 
 
 
329 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  24.62 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  27.8 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  23.3 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
345 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  26.64 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0356  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  22.91 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.11 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  26.48 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.23 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  27.69 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  22.52 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  26.7 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1334  oxidoreductase  25.85 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  27.36 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  24.06 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.02 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  25.27 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>