More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0762 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
378 aa  779    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  77.75 
 
 
379 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  76.94 
 
 
377 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  71.24 
 
 
377 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  74.2 
 
 
399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  59.42 
 
 
381 aa  484  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 
346 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
382 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  31.84 
 
 
360 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 
376 aa  136  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  27.32 
 
 
370 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  27.94 
 
 
369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 
366 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.69 
 
 
382 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
377 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.66 
 
 
377 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
369 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
376 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.54 
 
 
377 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 
377 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  31.54 
 
 
377 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30.71 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.32 
 
 
378 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  29.12 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  29.93 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  28.83 
 
 
371 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  29.96 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 
375 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.74 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  30.08 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
373 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
384 aa  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  25.82 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.08 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
373 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 
367 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  27.39 
 
 
371 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.79 
 
 
387 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
398 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 
373 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 
391 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
387 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
381 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
329 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
382 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  26.85 
 
 
390 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3402  oxidoreductase, putative  28.78 
 
 
338 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336464  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 
377 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 
373 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  32.44 
 
 
374 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
364 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0189  putative oxidoreductase  26.47 
 
 
366 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.329829  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.13 
 
 
366 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08211  putative oxidoreductase  26.47 
 
 
366 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.839284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
347 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
378 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
371 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
393 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 
387 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
366 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 
378 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 
390 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  30.89 
 
 
377 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  25.34 
 
 
349 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 
385 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  33.18 
 
 
359 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  26.52 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 
397 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  28.32 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.16 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0790  putative oxidoreductase  26.1 
 
 
365 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  29.45 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.82 
 
 
342 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  28.7 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
365 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  28.46 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  28.45 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  23.82 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  28.89 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.1 
 
 
313 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>