More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3305 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
373 aa  743    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 
373 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 
346 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  28.57 
 
 
387 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
376 aa  119  6e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4205  oxidoreductase-like  24.32 
 
 
371 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 
382 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  30.17 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  25.86 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  35.41 
 
 
386 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 
379 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1578  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.43 
 
 
377 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00538789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
366 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0762  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 
378 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
373 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4781  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
317 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5228  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
345 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596346  normal  0.783327 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5496  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 
345 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.025738 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.87 
 
 
377 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
396 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
370 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
370 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4400  oxidoreductase-like protein  30.83 
 
 
317 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4487  oxidoreductase domain-containing protein  30.83 
 
 
317 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
378 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
377 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 
371 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  33.91 
 
 
371 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0948  oxidoreductase domain protein  33.18 
 
 
382 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.191297  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3183  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 
369 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0118755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  30.49 
 
 
371 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  30.49 
 
 
371 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  29.05 
 
 
386 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 
359 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 
378 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  32 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 
373 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 
384 aa  96.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  25.82 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 
373 aa  96.3  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.75 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.35 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  35.63 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  27.25 
 
 
366 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  32.65 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 
377 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  24.03 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  30.8 
 
 
399 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
372 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.97 
 
 
381 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  31.3 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  36.48 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  27.46 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 
348 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  22.25 
 
 
385 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
347 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  28.73 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.35 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.36 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3266  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  28.76 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2993  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00237392  hitchhiker  0.000625916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.73 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  35.8 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  28.73 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  27.7 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  33.01 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  27.65 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  24.6 
 
 
359 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  32.8 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  32.99 
 
 
380 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  29.78 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3807  oxidoreductase domain-containing protein  33.46 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.03 
 
 
346 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  30.74 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>