More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5816 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  78.54 
 
 
396 aa  673    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
397 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  83.04 
 
 
401 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  60.81 
 
 
399 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  60.81 
 
 
399 aa  511  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  57.25 
 
 
396 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  39.37 
 
 
347 aa  261  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1739  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
414 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0261  oxidoreductase-like  28.68 
 
 
414 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4117  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
414 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0394  oxidoreductase-like protein  28.1 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0623  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.075929  normal  0.225724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
388 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0814  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0302  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00604537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
340 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 
366 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  25.58 
 
 
390 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.53 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
386 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
385 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 
385 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.42 
 
 
387 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 
353 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 
396 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.19 
 
 
371 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  27.41 
 
 
367 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 
393 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.19 
 
 
371 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.93 
 
 
376 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 
386 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  26.46 
 
 
382 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  25.42 
 
 
387 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
377 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
367 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  28.21 
 
 
337 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 
377 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
387 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 
387 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
376 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.17 
 
 
378 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  26.22 
 
 
386 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2251  oxidoreductase  27.39 
 
 
341 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00205292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.02 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  27.21 
 
 
345 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  28.45 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  28.45 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.02 
 
 
341 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 
359 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25.09 
 
 
334 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.43 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  28.45 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.41 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  24.87 
 
 
376 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
333 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  25.78 
 
 
335 aa  96.3  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 
377 aa  96.3  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 
338 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  25.27 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  22.96 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.22 
 
 
330 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
337 aa  95.5  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  26.38 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 
373 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 
371 aa  94  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.99 
 
 
329 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 
397 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.17 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
326 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 
382 aa  94  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  24.47 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
341 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 
345 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
347 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0643  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
343 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1191  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 
332 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0424624  hitchhiker  0.0000632942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25 
 
 
329 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 
390 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 
333 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  26.72 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  25.72 
 
 
335 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  25.95 
 
 
331 aa  89.7  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  26.46 
 
 
368 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
667 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.63 
 
 
337 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  24.13 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.24 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 
331 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>