More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3060 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  710    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  81.1 
 
 
344 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  81.1 
 
 
344 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  65.89 
 
 
352 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  56.89 
 
 
351 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  49.38 
 
 
343 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 
344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 
347 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
336 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  27.76 
 
 
341 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 
341 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  30.64 
 
 
368 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  26.27 
 
 
366 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.11 
 
 
387 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 
337 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 
347 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 
364 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
345 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
396 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 
362 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 
376 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.14 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  26.04 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  23.8 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24.65 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  23.65 
 
 
376 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  23.65 
 
 
376 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.67 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.44 
 
 
329 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
325 aa  85.9  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.52 
 
 
387 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  26.06 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0274  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  24.77 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  24.66 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.29 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  26.29 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  25.8 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.77 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23.46 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.67 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.62 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  25.75 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  26.21 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.19 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.24 
 
 
404 aa  79.3  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  24.64 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  22.79 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  24.88 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  26.32 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  24.58 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5584  oxidoreductase  27.27 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0916209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  28.98 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2609  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0353997  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0028  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  23.98 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>