More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 323 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.93 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04114  NADP(+) coupled glycerol dehydrogenase (Eurofung)  28.05 
 
 		 682 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.47 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  28.73 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  28.4 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  22.74 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  22.94 
 
 		 438 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  27.41 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  25.29 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  30.2 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  33.7 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  26.05 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.9 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.9 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.9 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.9 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.24 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.6 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.45 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  24.09 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  29.39 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.9 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  24.9 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.52 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 432 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 433 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.19 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  26.15 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  25.2 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  29.23 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  25.86 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  23.87 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  24.77 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  27.27 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  25.51 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0344  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  25.51 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  28.07 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  25.51 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  30.04 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  24.22 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  26 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0169  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.330568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  25.7 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  24.77 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  23.81 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  26.17 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  27.58 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.41 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>