More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1313 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 347 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  49.11 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  51.19 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  46.75 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  38.4 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  31.91 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  33.56 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  26.46 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  30.9 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.51 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  38.07 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  23.91 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0737  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  24.72 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4459  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  34.98 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4981  oxidoreductase-like  26.26 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6853  Inositol 2-dehydrogenase  30.72 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0554885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  29.02 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  27.4 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  26.42 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  31.82 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.76 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  28.78 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  28.79 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.89 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  33.67 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  30.84 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.26 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  26.09 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  29.49 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  20.9 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  27.82 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.19 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0203  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0209  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  27.59 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  28.38 
 
 		 362 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  31.02 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  29.7 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0947  oxidoreductase domain-containing protein  37.88 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1884  oxidoreductase domain-containing protein  40.59 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0599  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  31.04 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1361  Inositol 2-dehydrogenase  26.69 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  30.47 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.49 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  24.22 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  21.79 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  36.54 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  23.17 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.57 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  29.57 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.57 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  29.3 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.4 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.84 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  27.47 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.61 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  31.29 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>