More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3394 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3394  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 336 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  33.53 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  34.02 
 
 		 351 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  33.04 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3954  oxidoreductase domain protein  35.45 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  32.68 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.5 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  27.8 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  28.23 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  28.23 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.41 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.18 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  31.93 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.08 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.91 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.18 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  29.75 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  24.83 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  24.72 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  27.9 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  37.59 
 
 		 694 aa  77  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  36.41 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2124  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  28.88 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.88 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  25.5 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  22.55 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  24.91 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1951  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.492369  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  29.69 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  28.42 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  32.65 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.63 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09420  myo-inositol dehydrogenase  33.14 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.89 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  28.27 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  23.6 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  30.25 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.39 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.08 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28.86 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  29.73 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  23.73 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  28.36 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  29.73 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  29.73 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  29.73 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  29.73 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  30.46 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  31.06 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.15 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  26.47 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  30.05 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  27.5 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  29.69 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  26.74 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>