More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3433 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  750    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  65.27 
 
 
362 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  54.47 
 
 
368 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  46.43 
 
 
376 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  46.43 
 
 
376 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  32.19 
 
 
360 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2752  oxidoreductase domain protein  29.13 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0315  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2277  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
353 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4126  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
352 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
344 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0241  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.37 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.803279  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3482  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4973  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 
360 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  25.87 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0234  putative oxidoreductase protein  27.95 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  25.99 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  25.29 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3060  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  23.72 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  25.28 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.09 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  26.84 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  27.86 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  23.44 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  21.17 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  29.11 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  23.68 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  23.63 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  21.15 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.21 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.45 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  26.5 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  25.15 
 
 
336 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  29.85 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.99 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.15 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  25.86 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  27.48 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.12 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  23.6 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1313  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.19 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  30.69 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2526  oxidoreductase, NAD-binding  26.24 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000937145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2332  oxidoreductase, NAD-binding  26.24 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2511  NAD-binding oxidoreductase  26.24 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.34 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0299  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.24 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  30.73 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  23.51 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  28.63 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  24.35 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  22.47 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  21.53 
 
 
383 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.75 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  25.77 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2295  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.74 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  28.92 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>