More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5395 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  73.26 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  72.67 
 
 		 344 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  63.64 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  46.67 
 
 		 341 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  43.58 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  36.13 
 
 		 370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 		 364 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  35.1 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  35.63 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  24.72 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 351 aa  92.4  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0322  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 		 391 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1468  oxidoreductase-like  26.85 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  24.91 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.2 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  22.55 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  24.16 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  28.42 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  25.08 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  21.78 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  23.44 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.51 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.13 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  32.21 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  22.61 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  28.9 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  29.21 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  22.29 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  22.29 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  22.97 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  28.89 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  35.2 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.34 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.86 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.45 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.07 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.27 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  24.25 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4759  oxidoreductase domain protein  25.99 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86109  normal  0.0244054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  24.7 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4755  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00177574  normal  0.507858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3062  oxidoreductase-like  25.76 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0932673  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2038  oxidoreductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.488565 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6269  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  30.89 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  22.77 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  29.28 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  23.9 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.43 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  27.95 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  30.64 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  24.48 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  24.56 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2313  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 616 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  30.08 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  23.98 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4342  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0507395  decreased coverage  0.00000099897 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0268  dehydrogenase related protein  31.65 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  21.88 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  30.38 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  23.67 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>