More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2952 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 366 aa  743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  77.05 
 
 		 366 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  76.29 
 
 		 366 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  56.86 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  47.51 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  48.63 
 
 		 377 aa  355  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  49.72 
 
 		 368 aa  352  7e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  51.12 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  47.4 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  46.98 
 
 		 377 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  51.41 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  47.8 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  50.99 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  51.7 
 
 		 374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  46.43 
 
 		 377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  46.74 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  47.68 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  46.17 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 368 aa  325  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  48.3 
 
 		 370 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  46.93 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  49.72 
 
 		 357 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  48.3 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  43.21 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  45.6 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  47.16 
 
 		 371 aa  295  9e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  46.18 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  43.98 
 
 		 372 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  43.98 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  44.79 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  44.74 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  46.78 
 
 		 375 aa  281  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  39.78 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  46.74 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  43.06 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  44.44 
 
 		 383 aa  275  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  44.54 
 
 		 373 aa  271  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  43.23 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  42.23 
 
 		 391 aa  265  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  41.69 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  42.37 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  37.25 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  36.15 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.18 
 
 		 644 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.51 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.51 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  30.39 
 
 		 657 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  24.8 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 665 aa  106  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  30.66 
 
 		 376 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  25.94 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.16 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  36.48 
 
 		 344 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 344 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  26.93 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  37.74 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  28.37 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  24.05 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  22.76 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.31 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.31 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.6 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  24.24 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.05 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  29.67 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  30.77 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.35 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.86 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.8 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  23.18 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  29.23 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  28.88 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  29.68 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.16 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>