More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17800 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 380 aa  752    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  50.94 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  51.91 
 
 		 364 aa  328  9e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  49.72 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  41.76 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  35.34 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  36.84 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  35.09 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  35.64 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  25.56 
 
 		 345 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5752  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.156023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  32.71 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.33 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0530  oxidoreductase-like protein  27.17 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0597685  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  27.99 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.43 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  28.93 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  26.84 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3433  oxidoreductase domain-containing protein  22.8 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.808299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  28.15 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1061  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  26.53 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  27.27 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  28.16 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.95 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  25.49 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  25.57 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  24.41 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01970  predicted dehydrogenase  29.82 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.395105 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  28.64 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.16 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  25 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  26.22 
 
 		 335 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4191  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  26.78 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  25.48 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  24.35 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.99 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  28.18 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 436 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  25.47 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3447  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  25.76 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.56 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  26.53 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.07 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1937  oxidoreductase domain-containing protein  25.78 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  27.16 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  24.92 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3518  oxidoreductase domain protein  30.2 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.911341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  27.6 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  29.54 
 
 		 347 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  24.86 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  37.78 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5570  trehalose utilization-related protein  31.06 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3688  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 339 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.6673  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 439 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  29.82 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.84 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  28.67 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  24.6 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>