More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4191 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4191  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
425 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0520  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 
416 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3615  oxidoreductase domain-containing protein  25.71 
 
 
417 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
388 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.28 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 
390 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.76 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  23.93 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  30.72 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  29.17 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  28.43 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  22.86 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  24.43 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  25.23 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3766  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4658  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.383619  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.22 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  25.25 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.42 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.54 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  25.51 
 
 
359 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  29.09 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.37 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  24.42 
 
 
325 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
1080 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  30.67 
 
 
383 aa  66.6  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  32.61 
 
 
362 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  31.22 
 
 
358 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  30.43 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1379  oxidoreductase-like protein  25.82 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  23.89 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.94 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
325 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4127  oxidoreductase domain protein  35.37 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0309  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.64 
 
 
348 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  30.05 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  25.13 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
1079 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 
377 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
337 aa  63.5  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 
369 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  26.19 
 
 
450 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
369 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.97 
 
 
362 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1336  oxidoreductase domain protein  25.44 
 
 
328 aa  63.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 
500 aa  63.2  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  26.52 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  26.01 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1925  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000551869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  33.57 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.68 
 
 
382 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  22.2 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  26.64 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  24.02 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  32.09 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  30.86 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.95 
 
 
359 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  24.19 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  26.34 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  26.13 
 
 
367 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  23.95 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.92 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  22.65 
 
 
385 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
352 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  27.62 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
311 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
470 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  28.08 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 
425 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
378 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  30.28 
 
 
346 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>