More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0976 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 379 aa  756    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  57.61 
 
 		 370 aa  418  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  60.17 
 
 		 378 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  60.59 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  56.43 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  54.12 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  54.95 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  46.92 
 
 		 373 aa  336  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  46.2 
 
 		 369 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  51.56 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  45.72 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  47.71 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  46.2 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  46.61 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  45.14 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  40.69 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  44.35 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  42.62 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  42.93 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  44.32 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  42.93 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  42.78 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  45.6 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  42.78 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  43.13 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  42.58 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  43.85 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  41.55 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  47.12 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  39.79 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  43.7 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  44.82 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  41.96 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  40.81 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  36.8 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  46.28 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  39.95 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  43.5 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  41.92 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 		 358 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  37.24 
 
 		 644 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 		 352 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 364 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  32.35 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 		 377 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  29.19 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  36.57 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.69 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.69 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  32.21 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  33.93 
 
 		 657 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.95 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  35.12 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  32.38 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 		 694 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  28.84 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.11 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.62 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.03 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.09 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.72 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 347 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  36.32 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  33.72 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  28.37 
 
 		 665 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  31 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  33.33 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  33.33 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>