More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0776 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  100 
 
 
391 aa  775    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  40.43 
 
 
388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  39.89 
 
 
377 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  39.95 
 
 
377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  39.62 
 
 
377 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  40.43 
 
 
377 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  38.3 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  43.72 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  41.93 
 
 
366 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  41.36 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  39.01 
 
 
382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  39.95 
 
 
379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  40.76 
 
 
373 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  41.03 
 
 
369 aa  235  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  39.5 
 
 
365 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  41.6 
 
 
378 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  39.43 
 
 
366 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  40.8 
 
 
374 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  38 
 
 
366 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  39.55 
 
 
366 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  38.54 
 
 
380 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  36.96 
 
 
377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  37.8 
 
 
370 aa  215  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  37.87 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  38.1 
 
 
366 aa  212  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  37.6 
 
 
357 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  36.64 
 
 
357 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  38.01 
 
 
366 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  33.78 
 
 
368 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  36.68 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  41.05 
 
 
375 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  36.8 
 
 
383 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
368 aa  185  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  35.11 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
372 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  34.31 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  36.98 
 
 
379 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  35.79 
 
 
368 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
373 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  33.98 
 
 
371 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  32.03 
 
 
380 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
358 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
356 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  33.15 
 
 
644 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
375 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 
364 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.73 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 
376 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  31.08 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  33.51 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  35.5 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.38 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.38 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  35.66 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  32.29 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  34.75 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.89 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  37.61 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  35.38 
 
 
665 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  31.63 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  36.3 
 
 
345 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1839  oxidoreductase domain-containing protein  32.26 
 
 
518 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.341255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.5 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.6 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1770  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
348 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.83 
 
 
362 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.38 
 
 
319 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  33.16 
 
 
310 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3305  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0192693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3073  oxidoreductase-like  31.94 
 
 
549 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.893125  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  29.63 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  35.9 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
382 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  36.88 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>