More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1864 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  92.35 
 
 		 366 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 366 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  76.14 
 
 		 366 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  58.94 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  52.54 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  49.16 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  50.84 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  52.12 
 
 		 374 aa  348  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  46.63 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  48.35 
 
 		 377 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  44.32 
 
 		 379 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  45.6 
 
 		 377 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  44.78 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  45.88 
 
 		 377 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  46.15 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  46.45 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  45.38 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  44.53 
 
 		 382 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  46.37 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  46.88 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  47.85 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  48.01 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  47.46 
 
 		 379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  44.2 
 
 		 377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  43.33 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  47.44 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  46.49 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  43.98 
 
 		 372 aa  288  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  43.38 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  44.79 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  43.7 
 
 		 373 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  48.48 
 
 		 375 aa  276  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  44.79 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  44.92 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  44.35 
 
 		 383 aa  272  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  42.77 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  46.46 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  42.49 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  38.42 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  36.73 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  36.54 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.1 
 
 		 644 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 352 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  29.69 
 
 		 657 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  27.1 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  31.59 
 
 		 665 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 376 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 		 350 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.12 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 		 347 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.54 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  34.36 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.18 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 667 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  27.08 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.01 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.34 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.18 
 
 		 375 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  31.71 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  29.96 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  31.03 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  27.11 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  22.91 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3470  oxidoreductase domain protein  31.43 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.27 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  24 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.71 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.46 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  33.89 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  24.59 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>