More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5340 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 375 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  59.29 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  58.97 
 
 		 373 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  56.33 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  56.91 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  56.56 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  56.99 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  56.7 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  51.85 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  54.37 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  52.01 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  50.7 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  51.37 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  50.14 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  50.28 
 
 		 374 aa  312  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  46.22 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  47.25 
 
 		 370 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  54.23 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  46.63 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  51.28 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  45.98 
 
 		 365 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  48.1 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  48.31 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  46.82 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  43.18 
 
 		 368 aa  288  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  45.92 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  48.46 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  46.57 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  44.64 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  47.87 
 
 		 371 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  41.58 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  48.55 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  40.16 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  41.5 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  40.66 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  42.66 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  38.07 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  41.95 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  40.29 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  41.05 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  38.24 
 
 		 644 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 		 352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.81 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.81 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.96 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.58 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  32.68 
 
 		 657 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  33.58 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  31.29 
 
 		 665 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.34 
 
 		 353 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  28.98 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  32.14 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.37 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  28.71 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  28.71 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8501  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.78 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  34.63 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  35.86 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  32 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  27.24 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.62 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  32.45 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1731  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.48 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  28.98 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.1 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.41 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  31.73 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>