More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3182 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  41.67 
 
 		 375 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  42.11 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.84 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.84 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  31.56 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  30.36 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 374 aa  129  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  36.76 
 
 		 644 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  29.05 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  25.26 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  28.22 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  28.77 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  28.24 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 373 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  29.32 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  27.67 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  30.31 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  30.99 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  28.93 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  31.69 
 
 		 368 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  36.73 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 380 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  31.89 
 
 		 665 aa  95.9  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  27.03 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  29.51 
 
 		 657 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  27.87 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 379 aa  89.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  31.71 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  31.11 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.46 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.6 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  29.35 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 667 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  28.75 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.02 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  26.98 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  29.3 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0182  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  33.93 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  27.36 
 
 		 667 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  26.69 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0736  oxidoreductase, NAD-binding  26.14 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.03 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  35.59 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0755  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  34.38 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  26.51 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0913  oxidoreductase-like  32.41 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  30.72 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1201  oxidoreductase-like  26.39 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  24.18 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  28.94 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0634  NAD-dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  34.9 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1805  oxidoreductase domain protein  27.23 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.759104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  30.18 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.05 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  34.53 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>