More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3988 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  100 
 
 		 365 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  59 
 
 		 366 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  59 
 
 		 366 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  56.86 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  52.04 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  51.92 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  52.96 
 
 		 369 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  49.72 
 
 		 370 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  46.43 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  45.92 
 
 		 377 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  44.84 
 
 		 377 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  48.32 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  45.96 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  47.89 
 
 		 379 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  49.29 
 
 		 357 aa  321  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  45.13 
 
 		 379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  45.08 
 
 		 382 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  44.66 
 
 		 382 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  43.09 
 
 		 379 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  43.29 
 
 		 377 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  48.83 
 
 		 378 aa  308  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  43.01 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  48 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  46.33 
 
 		 357 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  40.76 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  45.76 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  42.58 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  42.05 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  45.96 
 
 		 375 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  44.23 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  45.01 
 
 		 383 aa  281  9e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  41.78 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  43.94 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  41.41 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  42.18 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  42.65 
 
 		 366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  41.39 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  40.92 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  41.74 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  39.63 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  38.48 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  35.8 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  33.06 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 644 aa  152  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  31.59 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.22 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.43 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.43 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  27.3 
 
 		 657 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 347 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  25.39 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.1 
 
 		 665 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 396 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.4 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  29.79 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  23.86 
 
 		 369 aa  87  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  27.3 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  24.91 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  23.21 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  37.93 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  22.02 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.13 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  29.1 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  22.74 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  26.77 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  22.63 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  23.82 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  25.89 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  25.9 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.77 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  32.62 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  23.69 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>