More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1601 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
378 aa  750    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  61.26 
 
 
379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  61.52 
 
 
370 aa  428  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  58.68 
 
 
379 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  58.84 
 
 
380 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  56.98 
 
 
357 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  51.12 
 
 
373 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  50.42 
 
 
369 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  50.98 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  52.45 
 
 
371 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  46.31 
 
 
368 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  47.63 
 
 
367 aa  324  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  48.41 
 
 
365 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  53.67 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  43.79 
 
 
368 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  46.22 
 
 
372 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  49.72 
 
 
366 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  48.87 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  53.17 
 
 
375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  45.25 
 
 
373 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  47.06 
 
 
366 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  43.17 
 
 
377 aa  298  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  45.66 
 
 
366 aa  298  9e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  47.35 
 
 
366 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  46.33 
 
 
366 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  45.61 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  41.6 
 
 
368 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
382 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  41.87 
 
 
382 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  40.37 
 
 
379 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  42.7 
 
 
357 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  41.21 
 
 
377 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  40.87 
 
 
377 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  42.74 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  45.3 
 
 
373 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  41.48 
 
 
377 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  46.63 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  39.84 
 
 
388 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  40.16 
 
 
377 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  42.47 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  44.9 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  41.71 
 
 
380 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  35.65 
 
 
356 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 
369 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  34.25 
 
 
644 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  29.28 
 
 
364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
363 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
377 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
385 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 
375 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  30.41 
 
 
657 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
350 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
387 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 
347 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.03 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  27.73 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  27.5 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
359 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.18 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.79 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
362 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.52 
 
 
355 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.49 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.49 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.79 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.79 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  28.68 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  32.87 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5612  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  26.88 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.76 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.86 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  33.57 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.33 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  27.55 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5443  oxidoreductase-like protein  27.06 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5840  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81938  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1682  oxidoreductase-like protein  27.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1711  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0541  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1655  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0542  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0624  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>