More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2092 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
377 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  96.82 
 
 
377 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  81.43 
 
 
377 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  79.84 
 
 
377 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  70.21 
 
 
388 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  60.64 
 
 
379 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  46.79 
 
 
382 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  45.99 
 
 
382 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  44.18 
 
 
368 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  45.45 
 
 
366 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  43.78 
 
 
367 aa  315  7e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  45.55 
 
 
373 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  44.73 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  43.84 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  45.01 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  43.66 
 
 
365 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  42.66 
 
 
368 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  42.93 
 
 
379 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  44.13 
 
 
374 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  43.53 
 
 
357 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  42.03 
 
 
377 aa  276  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  40.11 
 
 
370 aa  265  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  38.77 
 
 
368 aa  265  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  39.62 
 
 
391 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  40.27 
 
 
380 aa  255  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  40.27 
 
 
357 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  40.11 
 
 
378 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  39.78 
 
 
366 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  39.62 
 
 
379 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  36.26 
 
 
366 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  39.46 
 
 
368 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  37.91 
 
 
372 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  40.73 
 
 
366 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  37.64 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  39.03 
 
 
371 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  39.73 
 
 
373 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  40.4 
 
 
375 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  37.46 
 
 
379 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  39.47 
 
 
383 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  38.51 
 
 
380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  38.38 
 
 
368 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  36.54 
 
 
383 aa  205  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  35.25 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  32.79 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
369 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
372 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  30.35 
 
 
644 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
364 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 
352 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  30.19 
 
 
657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.84 
 
 
665 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 
377 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 
378 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.66 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.66 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.19 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2064  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.9 
 
 
353 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.11 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
345 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  25.95 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  26.44 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  27.02 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  26.59 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  27.02 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.76 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.61 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  29.72 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2497  oxidoreductase domain-containing protein  25.13 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.16 
 
 
319 aa  77  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.33 
 
 
343 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  25.31 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.7 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.57 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  28.93 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>