More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2540 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 379 aa  758    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  67.96 
 
 		 373 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  63.46 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  59.34 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  55.25 
 
 		 372 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  55.5 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  56.56 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  56.41 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  52.76 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  52.49 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  52.09 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  44.02 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  44.47 
 
 		 379 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  44.44 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  43.87 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  43.15 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  45.26 
 
 		 379 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  43.23 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  42.57 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  44.04 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  41 
 
 		 368 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  43.97 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  44.92 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  46.61 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  43.7 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  44.54 
 
 		 371 aa  262  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  40.17 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  40.92 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  40.27 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  37.7 
 
 		 388 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  39.18 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  38.08 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  36.8 
 
 		 368 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  36.22 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  37.67 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  44.38 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  39.25 
 
 		 382 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  35.8 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  36.89 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 356 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.42 
 
 		 644 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  33.05 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  28.53 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  32.07 
 
 		 657 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.06 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  27.12 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.06 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 385 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  31.01 
 
 		 665 aa  90.1  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  35.58 
 
 		 376 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.2 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  30.11 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.74 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.62 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  23.92 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  27.55 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  29.62 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.25 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  26.51 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2855  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  34.57 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  26.85 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  28.39 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  24.3 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2457  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79412  normal  0.791445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2017  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  27.38 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  26.51 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3639  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>