More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  702    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  67.51 
 
 		 370 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  64.97 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  54.12 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  57.27 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  57.57 
 
 		 378 aa  355  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  55.71 
 
 		 380 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  56.34 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  48.57 
 
 		 373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  48.02 
 
 		 369 aa  325  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  48.87 
 
 		 367 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  49.27 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  47.86 
 
 		 374 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  42.33 
 
 		 368 aa  299  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  47.48 
 
 		 366 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  47.77 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  45.33 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  48.28 
 
 		 366 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  43.43 
 
 		 368 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  44.92 
 
 		 366 aa  279  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  47.32 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  44.11 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  44.19 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  43.9 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  42.7 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  50.61 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  41.05 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  41.42 
 
 		 379 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  42.7 
 
 		 377 aa  262  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  40.61 
 
 		 382 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  45.4 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  40.27 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  40.43 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  40.27 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  43.43 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  43.45 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  38.75 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  45.09 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  42.98 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  40.95 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  43.84 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  37.6 
 
 		 391 aa  206  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 		 644 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 		 369 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  29.11 
 
 		 657 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.33 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.03 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.84 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.84 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.15 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  29.15 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.17 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  36.04 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  27.05 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.12 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.3 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  25.78 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0163  dehydrogenase related protein  28.05 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000150433  hitchhiker  2.83341e-20 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01940  predicted dehydrogenase  31.4 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  27.2 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  28.71 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.95 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  22.99 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  33.57 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.89 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  26.55 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  29.56 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  25.38 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  26.44 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  25.68 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>