More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1683 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  92.35 
 
 
366 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
366 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  77.05 
 
 
366 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  58.94 
 
 
365 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  53.41 
 
 
369 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  52.11 
 
 
373 aa  362  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  49.44 
 
 
368 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  51.13 
 
 
367 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  46.63 
 
 
368 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  51.84 
 
 
374 aa  345  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  44.86 
 
 
379 aa  342  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  47.25 
 
 
377 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  46.3 
 
 
377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 
377 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  45.75 
 
 
377 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  46.43 
 
 
388 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  46.37 
 
 
366 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  44.72 
 
 
382 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  44.29 
 
 
382 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  44.26 
 
 
379 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  47.46 
 
 
379 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  47.56 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  46.31 
 
 
370 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  44.2 
 
 
377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  47.19 
 
 
357 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  46.2 
 
 
378 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  41.16 
 
 
368 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  46.31 
 
 
371 aa  293  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  44.41 
 
 
372 aa  291  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  44.41 
 
 
373 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  43.7 
 
 
368 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  45.03 
 
 
366 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  43.94 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  45.1 
 
 
373 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  48.48 
 
 
375 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  44.63 
 
 
383 aa  278  9e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  43.35 
 
 
379 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  43.87 
 
 
383 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  45.43 
 
 
380 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  41.97 
 
 
368 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  40.05 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  37.61 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  36.21 
 
 
356 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  36.26 
 
 
358 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 
644 aa  192  9e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  31.94 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
363 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.33 
 
 
378 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.33 
 
 
378 aa  136  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
352 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
657 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  29.09 
 
 
378 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
369 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
364 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
377 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
385 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  30.38 
 
 
665 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.07 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  24.38 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  28.74 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
667 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  28 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 
377 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  27.59 
 
 
376 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  29.68 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.46 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.71 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 
369 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  26.02 
 
 
364 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
375 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  27.58 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  21.8 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  24.74 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  29.85 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6724  oxidoreductase protein  31.71 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.826358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.91 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.17 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  29.36 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  35.85 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  25.55 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  29.14 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29090  predicted dehydrogenase  29.22 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  30.04 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  35.85 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.98 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  25.9 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  24.24 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.4 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>